История Теологического института тесно связана с историей  Евангелическо-лютеранской Церкви Ингрии.

Возрождение лютеранства в России в конце 80-х годов прошлого века вызвало необходимость в подготовке священнослужителей и приходских работников.

Первая образовательная программа была реализована Церковью Ингрии на базе прихода города Пушкин в 1989 году.

Позже обучение стало проходить в Санкт-Петербурге на базе прихода Святой Марии, затем –  церкви Святого Георгия в Колтушах.

В 1994 году организация «Финская церковная помощь» подарила комплекс зданий для организации Учебного центра (нынешнего Теологического Института), который и был освящен 27 августа 1995 года как Учебно-диаконический центр им. С.Я. Лауриккала.

29 марта 2000 года Учебный центр стал самостоятельным юридическим лицом, 27 декабря 2005 года получил название  — Религиозная организация, учреждение профессионального религиозного образования «Теологический Институт Евангелическо-лютеранской Церкви Ингрии на территории России». Решением Рособрнадзора от 2 июня 2016 года был переименован в Религиозную духовную образовательную организацию высшего образования "Теологический Институт Евангелическо-Лютеранской Церкви Ингрии".